Joseph Vaz là người con thứ ba trong gia đình có sáu anh em. Cha mẹ của ông là Cristóvão Vaz và Maria de Miranda, họ đều là những người Công giáo rất mộ đạo. Ông được rửa tội khi được tám ngày tuổi tại nhà thờ giáo xứ Thánh Gioan Tẩy Giả[4].

Vaz học tại trường tiểu học ở Sancoale. Ông biết tiếng Bồ Đào Nha và tiếng Latin. Do học hành chăm chỉ, ông được cha đưa đến thành phố Goa để học nâng cao thêm. Tại đó, ông đã học một khóa biện và nhân văn tại trường Thánh Phaolô. Ông tiếp tục nghiên cứu về triết học và thần học tại St. Thomas Aquinas, một học viện của Dòng Đa Minh ở thành phố Goa.

Năm 1675, Vaz được phong chức phó tế phục vụ trong Tổng Giáo phận Goa do Giám mục Custódio de Pinho, Đại Diện Tông Tòa Bijapur và Golconda ban.Năm 1676, ông được Tổng Giám mục Goa, António Brandão, phong chức linh mục. Một thời gian ngắn sau khi chịu chức, ông bắt đầu đi chân trần và sống cùng những người nghèo khổ. Ông là một nhà giảng thuyết và giải tội được nhiều người biết đến. Ông đã mở một trường dạy tiếng Latin ở Sancoale để tìm kiếm những chủng sinh mới.Năm 1677, ông đã thánh hiến chính mình như một "nô lệ của Đức mẹ Maria", chứng cứ thánh hiến được ghi lại trong một tài liệu và sau đó tài liệu này đã được niêm phong. Tài liệu đó được gọi là "Chứng thư Bondage".